Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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FOXC1Q12948 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
FOXC1Q12948 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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