Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF1Q12946 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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