Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHRNEQ04844 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms