Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms