Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms