Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPRGP23470 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms