Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ODC1P11926 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ODC1P11926 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
ODC1P11926 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ODC1P11926 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms