Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRCP08575 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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PTPRCP08575 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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