Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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