Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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