Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CBFBQ13951 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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