Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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GPS1Q13098 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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