Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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FOXD4Q12950 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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