Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 TRERF1-204ENST00000372922 7286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms