Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ACADSBP45954 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms