Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PRKCHP24723 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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