Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PFDN4Q9NQP4 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms