Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB105A-201ENST00000334773 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LCMT1-AS1-202ENST00000563962 766 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR5-AS1-205ENST00000587691 441 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL358394.3-202ENST00000599308 832 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL109933.4-201ENST00000612111 157 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GLRA4-201ENST00000372617 1795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HAVCR1-205ENST00000523175 1449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TAAR8-201ENST00000275200 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms