Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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