Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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