Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PSMD6Q15008 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms