Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms