Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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