Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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