Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZFP2-205ENST00000523286 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP000781.1-201ENST00000534162 311 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 UGT2B4-206ENST00000512583 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AHCYL2-208ENST00000474594 2047 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 HERC2P5-201ENST00000562687 3825 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC009090.4-201ENST00000623921 3691 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL590326.1-201ENST00000460857 334 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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CLN3Q13286 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC125421.2-201ENST00000580370 583 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CDC37L1-AS1-201ENST00000607997 463 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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