Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BNIP1Q12981 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms