Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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