Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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