Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCAMP43121 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCAMP43121 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MCAMP43121 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms