Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms