Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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