Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2J1Q9Y385 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms