Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRQQ9UMZ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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