Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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