Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC6Q9UBN7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC6Q9UBN7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms