Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHPF2Q9P2E5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms