Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SALL1Q9NSC2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SALL1Q9NSC2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms