Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTPS2Q9NRF8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS2Q9NRF8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms