Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPHK2Q9NRA0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPHK2Q9NRA0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms