Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms