Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC17Q9NP64 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms