Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRHQ9HD43 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRHQ9HD43 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms