Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB1BQ9H0U4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB1BQ9H0U4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB1BQ9H0U4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB1BQ9H0U4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms