Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMG1Q96Q15 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMG1Q96Q15 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms