Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A3Q96HJ5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms