Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTHRC1Q96CG8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms