Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED12Q93074 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED12Q93074 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED12Q93074 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED12Q93074 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED12Q93074 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED12Q93074 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED12Q93074 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MED12Q93074 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED12Q93074 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED12Q93074 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms