Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJA4Q8WW22 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms