Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAT3Q8TDW7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAT3Q8TDW7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms