Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRWD3Q6RI45 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRWD3Q6RI45 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms